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5극3특 연구개발특구 딥테크 지원 (기획형 창업)

1. 사업개요

□ 사업목적

ㅇ 연구개발특구를 중심으로 한 지역경제 발전 및 딥테크 창업 활성화를 위해, 딥테크 발굴부터 창업팀 기반 스타트업 설립 중점 지원

□ 사업내용

ㅇ 특구 소재 공공연구기관과 투자·보육 등 민간 전문가 그룹 주도로, 사업화 가능성이 높은 딥테크 발굴에서 창업팀 빌딩, 연구소기업 등 기업 설립까지 기획형 창업 지원

2. 지원내용

□ 2026년 예산규모 : 총 2,000백만원

* 단, 지원과제 선정 과정에서 적정과제 선정기준에 미달되는 경우 총 예산규모 변동 가능

□ 정부지원 연구개발비 규모 : 과제별 최대 50백만원 이내

* 과제별 지원규모 및 금액은 평가위원회 및 심의위원회(기술사업화추진위원회), 과학기술정보통신부의 검토 결과 등에 따라 조정될 수 있음

□ 지원기간 : 협약 시작일로부터 2026년 12월 31일까지

□ 신청자격 : 공공연구기관 및 창업 전문 지원기관 등으로 구성된 컨소시엄*

* 단, 주관연구개발기관으로 본 사업을 위한 창업팀 구성·지원 등 자체적인 사업수행이 가능한 공공연구기관이 지원하는 경우, 공동연구개발기관과의 컨소시엄 없이 참여 가능

ㅇ 주관연구개발기관 : 연구개발특구 내에 소재한 공공연구기관*(TLO 등) 또는 기술지주회사

* 공공연구기관: 연구개발특구의 육성에 관한 특별법 제2조제5호에 해당하는 기관(아래 참조)

[공공연구기관 범위] 가. 국립연구기관 나. 정부출연연구기관(특정연구기관 육성법, 과학기술분야 정부출연연구기관 등의 설립·운영 및 육성에 관한 법률 적용기관) 다. 그 밖에 다른 법률에 따라 설립된 연구개발과 관련된 법인(대통령령) 1. 「고등교육법」 제2조에 따른 학교(산학협력단 포함) * 동 조건에 포함되는 공공연구기관의 소재지는 종된 분단도 포함 2. 「국방과학연구소법」에 따른 국방과학연구소 3. 「산업기술혁신 촉진법」 제42조제1항에 따른 전문생산기술연구소 4. 국가, 지방자치단체, 「공공기관의 운영에 관한 법률」 제5조에 따른 공기업 또는 준정부기관으로부터 연구개발 사업에 드는 연간 비용의 2분의 1 이상을 출연받거나 보조받는 법인 5. 「공익법인의 설립·운영에 관한 법률」에 따라 설립된 법인으로서 같은 법 시행령 제2조 제1항 제3호에 따라 학문 또는 과학기술의 연구·조사·개발·보급을 목적으로 하는 사업을 수행하는 법인 6. 「공공기관의 운영에 관한 법률」 제4조에 따른 공공기관으로서 「기초연구진흥 및 기술개발지원에 관한 법률」 제14조의2제1항에 따른 기업부설연구소 또는 연구개발전담부서를 둔 공공기관 7. 「보건의료기술 진흥법」 제15조제1항에 따라 연구중심병원으로 인증받은 병원 8. 그 밖에 제1호부터 제7호까지에 준하는 법인으로서 연구개발 성과의 사업화를 지원하기 위하여 과학기술정보통신부장관이 정하여 고시하는 기관 * 동 조건에 포함되는 공공연구기관의 부설연구소(분원)도 포함

ㅇ 공동연구개발기관 : 공공연구기관 또는 창업 전문 지원기관(컴퍼니빌더 등 기술창업 및 스케일업을 위한 지원기관)

[창업 전문 지원기관 유형] 가. 「벤처투자 촉진에 관한 법률」 제24조에 따라 중소벤처기업부에 등록한 창업기획자 나. 「벤처투자 촉진에 관한 법률」 제37조에 따라 중소벤처기업부에 등록한 벤처투자회사 다. 「벤처기업육성에 관한 특별법」 제2조제8항에 따른 신기술창업전문회사 라. 「산업교육진흥 및 산학연협력촉진에 관한 법률」 제2조제8호에 따른 산학연협력기술지주회사 마. 「산업교육진흥 및 산학연협력촉진에관한 법률」 제36조의2에 의한 기술지주회사 바. 「기술의 이전 및 사업화 촉진에 관한 법률」 제2조제10호에 따른 공공연구기관첨단기술지주회사 사. 「기술의 이전 및 사업화촉진에 관한 법률」 10조에 의한 기술거래기관 아. 「기술의 이전 및 사업화촉진에 관한 법률」 12조의2에 의한 사업화전문회사 자. 「연구산업진흥법」 제6조에 의한 전문연구사업자(동법 시행령 별표1의 연구관리산업 중 “연구개발 기획 및 과제 관리업” 및 “연구개발 성과 관리 활용 지원업”에 한함)

	유의사항(신청자격)
o 기술지주회사가 주관연구개발기관이 되는 경우, 공공연구기관은 공동연구개발기관으로 필수 참여 o 주관 또는 공동연구개발기관으로 상기 창업 전문 지원기관이 1개 이상 참여하는 경우, 과제수행에 필요하다고 판단되면 이에 해당하지 않는 기관도 공동연구개발기관으로 참여 가능 o 본 사업은 공공연구기관이 보유한 딥테크 관련 연구자의 창업 또는 사업화 참여를 권고하며, 이에 따라 동일 기관에서 사업화 대상 딥테크별로 과제지원 가능(단, 해당 기술 연구자 참여 필수)

□ 지원내용

ㅇ (딥테크 발굴) 공공연구기관이 보유한 우수 딥테크를 활용한 제품·서비스 발굴 등 사업화 검토

ㅇ (창업팀 구성) 공공연구기관과 창업 전문 지원기관 등이 창업팀을 구성하여, 예비 창업자와 연구자 연계 및 비즈니스모델 수립, 목표시장 분석 등 창업 기획 지원

ㅇ (기업 설립) 딥테크 기반 연구소기업·스타트업 창업 지원(인허가 등) 및 초기 기업운영 지원

ㅇ (기술 실증) 시작품 제작 및 신뢰성 평가, 인증 등 사업화 전략 수립을 위한 기술 검증

	유의사항(지원내용 등)
1. 과제수행 o 공공연구기관 연구자의 창업팀 참여, 딥테크 스타트업 또는 연구소기업 설립을 위한 과제수행이 필요함 o 과제별 1개 딥테크 스타트업에 대한 기획형 창업 집중 지원함(딥테크 발굴, 창업팀 구성, 기업 설립, 기술실증 등 통합 지원) o 과제 종료 전까지, 설립된 기업에 딥테크 공공기술에 대한 기술이전(출자) 계약 체결 또는 기술이전 추진에 대한 확약사항이 증빙되어야 하며, 연구소기업 등록 또는 스타트업 창업이 완료되어야 함(불가피한 상황이 발생한 경우 전문기관과 사전 협의 필요) 2. 연계지원 o ‘26년 기획형 창업(1단계) 종료 이후 ’27년 2단계(초기 스케일업) 과제에 연계 지원할 수 있음 o 본 사업을 통한 창업기업이 연구소기업으로 등록하는 경우에는 2단계 연계 지원 시 우대 제공

□ 정부지원연구개발비 및 기관부담연구개발비 현금비율 : 전액(100%) 정부지원연구개발비 지원

* 단, 간접비를 계상하는 경우, 직접비의 5% 이내 계상 가능(현물, 위탁연구개발비, 국제공동연구개발비, 연구개발부담비 제외)

□ 연구개발성과로 인한 수익의 납부 : 해당없음

□ 연구장비 관리에 관한 사항 : 연구장비 계상 불가

□ 영리기관 소속의 참여연구원 인건비 현금산정 기준

ㅇ 신규채용 : 중소‧중견기업의 경우 해당 과제 수행을 위해 신규로 채용하는 연구원의 인건비 계상률에 따른 인건비를 현금으로 산정 가능

- 신규채용 연구원 기준 : 사업공고일 기준 6개월 이전부터 과제 종료 시까지 채용된 인력

- 신규채용 인건비 현금 산정(집행) : 채용일(과제 시작일)부터 과제 종료일까지 가능

* 과제 시작일 이전의 인건비는 집행 불가

ㅇ 사업개시일로부터 협약기간 시작일까지 7년이 지나지 않은 창업기업의 인건비

ㅇ 전문연구사업자 : 연구개발비 사용기준 제65조제4항제2호에 따라, 전문연구사업자로 신고한 연구개발기관 소속 참여연구자의 인건비

ㅇ 지식서비스·SW·설계 : 지식서비스분야, S/W 또는 설계기술 과제를 수행하는 연구개발기관 소속 연구자의 인건비

- 세부 지원가능 분야는 첨부 참고자료(영리기관의 인건비 현금인정 분야)에 따르되, 해당 분야로 신청하였더라도 선정평가위원회에서 인정하지 않을 경우 현금산정 불가

□ 연구개발성과의 소유(국가연구개발혁신법 제16조 및 동법 시행령 제32조)

ㅇ 연구개발성과는 해당 연구개발과제를 수행한 연구개발기관이 소유하는 것이 원칙임

ㅇ 연구개발과제에의 참여 유형과 비중에 따라 여러 연구개발기관이 공동으로 소유할 수 있으며, 세부 기준은 다음을 따름

- 여러 연구개발기관이 각자 연구개발성과를 창출한 경우 : 연구개발성과를 창출한 연구개발기관이 해당 연구개발성과를 소유

- 여러 연구개발기관이 공동으로 연구개발성과를 창출한 경우 : 연구개발성과를 창출한 기여도를 기준으로 소유비율을 정하되, 연구개발기관 간의 협의에 따라 연구개발성과의 소유비율 및 연구개발성과실시(연구개발성과를 사용ㆍ양도ㆍ대여 또는 수출하거나 연구개발성과의 양도 또는 대여의 청약을 하는 행위를 말한다. 이하 같다) 등에 관한 사항을 정한 경우에는 그 협의에 따름

- 위탁연구개발기관이 연구개발성과를 창출한 경우 : 주관연구개발기관이 소유

- 외국에 소재한 기관ㆍ단체 또는 외국인과 공동으로 연구를 수행하는 경우 : 연구개발성과를 국내 소재 연구개발기관의 소유로 하거나 국내 소재 연구개발기관에게 우선 실시권을 부여하여야 함

ㅇ 아래의 경우에는 연구개발성과를 국가의 소유로 할 수 있음

- 국가안보를 위하여 필요한 경우

- 공공의 이익을 목적으로 연구개발성과를 활용하기 위하여 필요한 경우

- 해당 연구개발기관이 국외에 소재한 경우

□ 연구개발과제수의 제한 : 본 사업은 관련법령 및 규정에 따른 ‘동시수행과제수 제한’ 과제에 해당하지 않음

< 관련법령 및 규정 >

ㆍ국가연구개발혁신법 : 제31조(국가연구개발사업 관련 부정행위의 금지), 제32조(부정행위 등에 대한 제재처분), 제35조(연구개발과제의 성실 수행), 시행령 제64조(연구개발과제 수의 제한) ㆍ국가연구개발사업 동시수행 연구개발과제 수 제한 기준(과기정통부 고시) ㆍ‘26년 국가연구개발사업 동시수행 연구개발과제 수 적용제외 과제(안)(국가과학기술자문회의 제75회 운영위원회 심의, 2025.10.22.)

3. 추진체계 및 추진절차

□ 사업 추진체계

			과학기술정보통신부					기술사업화 추진위원회(심의·조정)
			시행계획 공고 및 관리·감독
			연구개발특구진흥재단 사업총괄본부
			전문기관
평가위원회
선정/최종평가
			주관연구개발기관						공동연구기관(n)
			전문기관·공동연구개발기관 협약체결/사업수행						협약체결/사업수행

□ 추진절차

공고 (과학기술정보통신부) ‘26. 4. 22. ~ 5. 21.	▶	사업신청 접수 ‘26. 5. 1. ~ 5. 21.	▶	사전검토 (연구개발특구진흥재단) `26. 6월 초	▶	선정평가 (평가위원회) `26. 6월 중	▶
신규과제 확정 `26. 6월 말	▶	평가결과 통보 및 이의신청 `26. 6월 말	▶	협약체결 `26. 7월 중	▶	과제 수행 `26. 7월 ~ 12월

※ 상기 일정과 방법 등은 변경될 수 있으며, 선정평가의 방법 및 절차에 중대한 하자가 있는 경우 1회에 한하여 이의신청할 수 있음(사전검토 결과에 대해서는 이의신청 불가)

4. 평가기준 및 유의사항

□ 평가기준

평가항목	세부항목	비중(%)
		서류	발표
창의성 및 도전성	• 기존 기술(제품∙서비스) 대비 차별성 및 목표의 혁신성	30	20
	• 목표 달성을 위한 위험요인 분석 및 해결 방안의 구체성
사업화 역량 및 필요성	• 사업 목적 부합성 및 지원 필요성	40	40
	• 연구자 및 수행기관의 기술사업화 추진 역량
	• 사업화 기술의 우수성 및 경쟁력
추진계획의 타당성	• 사업 수행 목표의 도전성 및 혁신성	20	20
	• 추진전략의 적정성 및 추진계획의 구체성
	• 사업 추진 체계의 명확성 및 추진방법의 창의성
활용가능성 및 파급효과	• 사업수행 성과의 활용 가능성	10	20
	• 기술사업화를 통한 사회적‧경제적 파급효과
계		100	100

※ 평가 항목 내 세부평가 항목기준은 평가/심의과정에서 일부 조정될 수 있음

□ 평가방법

ㅇ 신규과제 선정평가는 평가 계획에 의거하여 서면평가, 서면검토 및 서류평가, 발표평가, 현장방문평가, 토론평가, 비대면평가 등의 형태로 운영할 수 있음

ㅇ 연구개발계획서의 발표는 연구책임자가 하는 것이 원칙임

ㅇ 신청과제의 평가를 통해 종합평점이 60점 이상인 과제는 ‘지원가능과제’, 종합평점이 60점 미만인 과제는 ‘지원제외’로 분류함

ㅇ ‘지원 가능 과제’로 분류된 경우라도 예산 범위가 초과한 경우에는 지원 대상에서 제외될 수 있음

ㅇ 최우선 순위 과제가 협약 전 선정제외 또는 협약체결을 포기하였을 경우, 예산 범위 내에서 ‘지원가능과제’ 중 차순위 과제가 순차적으로 지원대상과제로 선정될 수 있음

ㅇ 선정된 과제의 연구개발비 및 연구개발기간 등은 평가결과에 따라 조정될 수 있으며, 과제 추진 중 관련규정에 따라 단계·특별평가 등을 통해 과제가 중단되거나 연구개발비가 조정될 수 있음

※ 관련 규정 : 국가연구개발혁신법 제12조(연구개발과제의 수행 및 관리) 제3항 및 제15조(특별평가를 통한 연구개발과제의 변경 및 중단)

ㅇ 과제신청 접수결과 경쟁률(선정예정기관 수 대비 신청기관 수)이 1:1 이하의 단독·미응모의 경우, 사업에 대해 2주 공고 연장 실시

- 연장 공고 후에도 경쟁률이 1:1일 경우는 지원가능 평가점수 기준을 60점 이상에서 75점 이상으로 상향하여 절대평가로 추진하며, 미응모의 경우는 재기획 후 공고 추진

□ 선정평가 시 우대사항 : 해당 없음

□ 선정평가 시 감점사항 : 최종점수 산출 시 감점기준에 따라 총점에서 차감

ㅇ 최근 3년 이내(접수마감일 기준) 부정행위로 판단되어 협약해약 및 제재처분 된 연구책임자나 기관(주관연구개발기관, 공동연구개발기관, 위탁연구개발기관 등)이 새로운 과제를 신청하는 경우(1점)

ㅇ 최근 3년 이내(접수마감일 기준) 연구개발과제 선정 후 또는 연구수행 도중 정당한 사유 없이 협약을 포기한 경력이 있는 연구책임자나 기관(주관연구개발기관, 공동연구개발기관, 위탁연구개발기관 등)이 새로운 과제를 신청하는 경우(1점)

ㅇ 접수마감일을 기준으로 연구개발기관(주관연구개발기관, 공동연구개발기관, 위탁연구개발기관 등) 또는 선정평가 대상 연구개발과제의 연구책임자(주관/공통/위탁 책임자 포함)가 부정행위 등에 대한 제재처분에 따른 제재부가금 또는 연구개발비 환수금의 전부 또는 일부를 납부기한 까지 납부하지 않은 경우(1점)

□ 신청자격 검토사항 및 사전지원제외 대상 : ‘연구개발특구육성사업 운영관리지침’의 제19조에서 제한하는 대상은 지원제외 대상으로 함

부실위험 확인 관련 제출증빙서류

▪’23년도~’25년도 결산 표준재무제표(국세청(홈텍스)발급) 또는 회계감사보고서

※ 단, 한국채택국제회계기준(K-IFRS)을 적용함에 따라 부채비율ㆍ유동비율에 문제가 발생하거나, 자본전액잠식이 발생한 경우에는 일반기업회계기준(K-GAAP)을 적용하여 부채비율, 유동비율, 자본전액잠식 여부 판단 가능. 이 경우, 연구개발기관은 부채비율 및 유동비율 등 판단을 위해 추가적인 회계기준에 따른 자료를 전문기관에 제출해야 하며, 한국채택국제회계기준과 일반기업회계기준을 혼용할 수 없음

※ 선정평가 이후 ‘연구개발특구육성사업 운영관리지침’의 제19조에서 제한하는 대상에 해당되는 것으로 확인된 경우, 해당과제의 선정 취소 또는 협약을 해약할 수 있음

□ 근거 법령 및 관련 규정

근거법령	o 국가연구개발혁신법, 동법 시행령 및 관련 행정규칙* * 국가연구개발사업 연구개발비 사용기준, 국가연구개발사업 연구노트 지침, 국가연구개발사업 동시수행 연구개발과제 수 제한기준, 국가연구개발 시설·장비의 관리 등에 대한 표준지침 등 o 과학기술기본법, 기초연구진흥 및 기술개발지원에 관한 법률 및 하위법령, 시행규칙 o 연구개발특구의 육성에 관한 특별법, 동법 시행령 및 시행규칙
관련규정	o 과학기술정보통신부 소관 과학기술분야 연구개발사업 처리규정 o 과학기술정보통신부 소관 연구개발특구육성사업 운영관리지침

5. 신청방법 및 절차

□ 사업공고

ㅇ 과학기술정보통신부(www.msit.go.kr)

ㅇ 국가과학기술지식정보서비스(https://www.ntis.go.kr)

ㅇ 연구개발특구포털(www.innopolis.or.kr)

ㅇ 범부처통합연구지원시스템(www.iris.go.kr)

□ 신청방법: 범부처통합연구지원시스템(www.iris.go.kr)을 통한 온라인 접수

ㅇ 신청 부문별 사업공고 확인(세부사업, 내역사업명 등) 후 신청 접수·완료

※ 과제 접수 전 필수 이행사항을 반드시 확인하시고 접수를 진행하여 주시기 바랍니다.
(별첨. 연구개발과제 접수 전 필수 이행 사항 및 매뉴얼 참고)

□ 접수기간 : ’26. 5. 1.(금) ~ ’26. 5. 21.(목), 15:00까지(IRIS 시스템 시간 기준)

□ 제출서류 : 제출 서류는 전자파일(PDF, 한글) 형태로 시스템 업로드

번호	서 류 명	서식	제출대상			파일형식
			주관	공동	위탁
1 (필수)	연구개발계획서	서식 1호 (Part 2)	O	-	-	HWP
2 (필수)	사업화 대상기술·제품 우수성 설명자료 ※ 자율서식, 10페이지 이내	-	O (주관이 대표로 제출)		-	PDF
3 (필수)	사업자등록증	-	O	O	O	PDF
4 (필수)	신청자격 적정성 확인서	서식 2호	O	O	O	PDF
5 (필수)	개인정보 및 과세정보 동의서	서식 3호	O	O	O	PDF
6 (필수)	연구윤리·청렴 및 보안서약서	서식 4호	O	O	O	PDF
7 (필수)	표준재무제표 또는 회계감사보고서 ※ 표준재무제표는 최근 3개년도(’23~‘25) 기준 국세청 홈택스 발급분	-	O	O	O	PDF
			※ 비영리기관 제출 제외
8 (필수)	국세 및 지방세 완납 증명서 ※ 신청일 기준 1개월 이내 발급분	-	O	O	O	PDF
			※ 비영리기관 제출 제외
9 (필수)	중소 또는 중견기업확인서 ※ 과제신청일 기준 각 해당기업의 확인서의 유효기간이 유효해야 함	-	O	O	O	PDF
			※ 비영리기관 제출 제외
10	전문연구사업자 증빙(원본대조필) ※ 해당기관(기술거래기관 지정서, 연구개발서비스업 신고증, 사업화전문회사 지정서 등)	-	해당시	해당시	해당시	PDF
11	연구개발기관의 연구개발비 사용 신청서	서식 5호	해당시	-	-	PDF
12	영리기관의 현금 계산 인건비 관리 계획 및 현황	서식 6호	해당시	해당시	해당시	PDF

※ 확인서 발급사이트: 중소기업확인서(http://sminfo.mss.go.kr), 중견기업확인서(https://mme.or.kr)

- 주의사항 : 중견기업 확인서는 신청일로부터 20일 이상 소요될 수 있음

	신청 시 주의사항
o 전산 등록기간 마감일에는 접속 폭주로 인한 접수지연 및 장애가 발생할 수 있으므로 사전에 접수 요망함 o 연구책임자가 온라인에 접속하여 접수마감일 15시까지 모든 과제 정보(신청항목)를 전산에 입력하고 제출 서류 업로드를 완료하여 ‘제출완료’ 상태인 연구개발계획서(과제)만 접수하는 것을 원칙으로 함. 전산 정보 입력 및 서류 업로드 시 상당 시간 소요될 수 있으며 기한 내에 제출되지 않은 과제는 미접수 처리됨. o 전산 등록 시, 주관연구개발기관의 연구책임자가 범부처통합연구지원시스템에 로그인하여 전산 등록 o 연구개발계획서 등의 전자파일은 반드시 신청서상의 내용과 일치하도록 정확하게 작성 후 사업관리시스템에 등록 제출 ※ 연구개발계획서의 기재사항 허위 작성 시 탈락 또는 협약해약 등 불이익 조치함 o 제출서류 중 필수서류를 전산접수하지 않은 경우 해당 과제는 사전지원제외 처리됨

□ 문의처(담당부서) : 연구개발특구진흥재단 사업총괄본부 사업조정실

ㅇ 담당자 : 표한슬 연구원(innoyuno@innopolis.or.kr/042-865-8834)

6. 기타사항

□ 신청서 및 구비서류의 미비한 사항에 대하여 연구책임자 연락처(사무실, 휴대전화, 이메일 등)로 요청할 수 있으며, 수정 및 보완 요청한 기한 내에 응하여야 함

□ 제출된 서류는 반환하지 않으며, 기재된 내용이 사실과 다를 경우 선정을 취소할 수 있음

□ 본 공고문에 명시되지 않은 사항은 동 사업 지침·기준 및 안내자료에서 정하는 바에 따르며, 지침․기준 등을 미숙지하여 발생하는 불이익 및 그에 따른 책임은 본 사업을 신청한 기업 및 수행기관에게 있음

□ 선정된 자가 공고문 및 관련 규정 등에 위배되거나, 사업 신청서의 내용을 허위 기재․누락한 경우 선정 취소, 정부 사업 참여제한 및 사업 지원금 환수 등의 조치를 받을 수 있음

□ 사업선정 시 정량지표 및 사업계획 관련 세부내용은 연구개발특구진흥재단과 협의하여 조정될 수 있음

□ 범부처통합연구지원시스템(IRIS)을 통한 연구개발과제 접수 전 필요 이행 사항, 관련 매뉴얼 미숙지에 따라 접수기한 내 최종제출되지 않은 과제는 미접수 처리됨